Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NMUP48645 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMUP48645 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMUP48645 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMUP48645 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMUP48645 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMUP48645 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMUP48645 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMUP48645 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMUP48645 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMUP48645 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMUP48645 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMUP48645 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NMUP48645 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMUP48645 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMUP48645 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMUP48645 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMUP48645 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMUP48645 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMUP48645 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMUP48645 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMUP48645 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMUP48645 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMUP48645 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMUP48645 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMUP48645 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMUP48645 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMUP48645 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NMUP48645 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMUP48645 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMUP48645 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMUP48645 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMUP48645 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMUP48645 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NMUP48645 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMUP48645 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMUP48645 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMUP48645 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMUP48645 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMUP48645 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMUP48645 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMUP48645 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMUP48645 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMUP48645 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMUP48645 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMUP48645 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMUP48645 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMUP48645 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMUP48645 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMUP48645 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMUP48645 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMUP48645 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMUP48645 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMUP48645 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMUP48645 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMUP48645 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMUP48645 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMUP48645 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMUP48645 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMUP48645 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMUP48645 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMUP48645 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMUP48645 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMUP48645 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMUP48645 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMUP48645 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMUP48645 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMUP48645 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMUP48645 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMUP48645 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMUP48645 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMUP48645 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMUP48645 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMUP48645 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMUP48645 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMUP48645 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMUP48645 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMUP48645 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMUP48645 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMUP48645 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMUP48645 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMUP48645 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMUP48645 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMUP48645 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMUP48645 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMUP48645 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMUP48645 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMUP48645 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMUP48645 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NMUP48645 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMUP48645 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMUP48645 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMUP48645 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMUP48645 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMUP48645 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMUP48645 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMUP48645 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMUP48645 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NMUP48645 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMUP48645 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms