Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PCP4P48539 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PCP4P48539 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCP4P48539 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCP4P48539 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCP4P48539 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCP4P48539 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCP4P48539 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCP4P48539 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCP4P48539 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCP4P48539 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCP4P48539 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCP4P48539 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCP4P48539 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCP4P48539 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCP4P48539 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCP4P48539 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCP4P48539 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCP4P48539 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCP4P48539 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCP4P48539 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCP4P48539 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCP4P48539 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCP4P48539 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCP4P48539 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCP4P48539 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCP4P48539 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCP4P48539 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCP4P48539 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCP4P48539 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCP4P48539 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PCP4P48539 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCP4P48539 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCP4P48539 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCP4P48539 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCP4P48539 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCP4P48539 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCP4P48539 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCP4P48539 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCP4P48539 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCP4P48539 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCP4P48539 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCP4P48539 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCP4P48539 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCP4P48539 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCP4P48539 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCP4P48539 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCP4P48539 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCP4P48539 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCP4P48539 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCP4P48539 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCP4P48539 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCP4P48539 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCP4P48539 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCP4P48539 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCP4P48539 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCP4P48539 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCP4P48539 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCP4P48539 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCP4P48539 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PCP4P48539 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCP4P48539 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCP4P48539 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCP4P48539 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCP4P48539 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCP4P48539 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCP4P48539 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PCP4P48539 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCP4P48539 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCP4P48539 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCP4P48539 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCP4P48539 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCP4P48539 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCP4P48539 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCP4P48539 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCP4P48539 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCP4P48539 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCP4P48539 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCP4P48539 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCP4P48539 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCP4P48539 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PCP4P48539 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCP4P48539 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCP4P48539 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCP4P48539 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PCP4P48539 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCP4P48539 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCP4P48539 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCP4P48539 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PCP4P48539 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PCP4P48539 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCP4P48539 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCP4P48539 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCP4P48539 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCP4P48539 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCP4P48539 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCP4P48539 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCP4P48539 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCP4P48539 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCP4P48539 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms