Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIA3P42263 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIA3P42263 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIA3P42263 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIA3P42263 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIA3P42263 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIA3P42263 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIA3P42263 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIA3P42263 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIA3P42263 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIA3P42263 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIA3P42263 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIA3P42263 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIA3P42263 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIA3P42263 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIA3P42263 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIA3P42263 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIA3P42263 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIA3P42263 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIA3P42263 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIA3P42263 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIA3P42263 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIA3P42263 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIA3P42263 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIA3P42263 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIA3P42263 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIA3P42263 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIA3P42263 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIA3P42263 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIA3P42263 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIA3P42263 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIA3P42263 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIA3P42263 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIA3P42263 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIA3P42263 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIA3P42263 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIA3P42263 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIA3P42263 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIA3P42263 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIA3P42263 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIA3P42263 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIA3P42263 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIA3P42263 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIA3P42263 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIA3P42263 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIA3P42263 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIA3P42263 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIA3P42263 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIA3P42263 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIA3P42263 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIA3P42263 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIA3P42263 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIA3P42263 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIA3P42263 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIA3P42263 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIA3P42263 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIA3P42263 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIA3P42263 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIA3P42263 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIA3P42263 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIA3P42263 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIA3P42263 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIA3P42263 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIA3P42263 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIA3P42263 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIA3P42263 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIA3P42263 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIA3P42263 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIA3P42263 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIA3P42263 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIA3P42263 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIA3P42263 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIA3P42263 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIA3P42263 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIA3P42263 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIA3P42263 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIA3P42263 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIA3P42263 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIA3P42263 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIA3P42263 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIA3P42263 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIA3P42263 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIA3P42263 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIA3P42263 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIA3P42263 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIA3P42263 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIA3P42263 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIA3P42263 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIA3P42263 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GRIA3P42263 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIA3P42263 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIA3P42263 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIA3P42263 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIA3P42263 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIA3P42263 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIA3P42263 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIA3P42263 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIA3P42263 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIA3P42263 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIA3P42263 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms