Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER1P34995 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER1P34995 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGER1P34995 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGER1P34995 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGER1P34995 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGER1P34995 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGER1P34995 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGER1P34995 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGER1P34995 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGER1P34995 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGER1P34995 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGER1P34995 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER1P34995 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER1P34995 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER1P34995 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER1P34995 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER1P34995 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER1P34995 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGER1P34995 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGER1P34995 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGER1P34995 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGER1P34995 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PTGER1P34995 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTGER1P34995 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTGER1P34995 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTGER1P34995 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTGER1P34995 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTGER1P34995 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PTGER1P34995 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTGER1P34995 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTGER1P34995 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTGER1P34995 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGER1P34995 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGER1P34995 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGER1P34995 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGER1P34995 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGER1P34995 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGER1P34995 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGER1P34995 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGER1P34995 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER1P34995 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER1P34995 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER1P34995 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER1P34995 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER1P34995 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER1P34995 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTGER1P34995 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGER1P34995 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGER1P34995 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGER1P34995 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGER1P34995 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGER1P34995 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGER1P34995 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGER1P34995 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGER1P34995 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGER1P34995 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGER1P34995 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGER1P34995 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGER1P34995 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGER1P34995 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGER1P34995 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGER1P34995 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGER1P34995 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGER1P34995 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGER1P34995 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGER1P34995 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGER1P34995 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGER1P34995 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGER1P34995 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGER1P34995 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGER1P34995 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGER1P34995 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGER1P34995 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGER1P34995 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGER1P34995 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGER1P34995 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGER1P34995 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGER1P34995 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGER1P34995 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGER1P34995 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGER1P34995 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGER1P34995 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGER1P34995 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTGER1P34995 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTGER1P34995 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGER1P34995 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGER1P34995 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGER1P34995 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGER1P34995 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGER1P34995 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGER1P34995 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGER1P34995 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGER1P34995 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGER1P34995 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGER1P34995 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGER1P34995 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGER1P34995 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGER1P34995 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGER1P34995 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms