Protein–RNA interactions for Protein: P28004

PRP45, Pre-mRNA-processing protein 45, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP45P28004 ELO1YJL196C 933 nt10.84□□□□□ -0.67
PRP45P28004 YJR149WYJR149W 1215 nt10.84□□□□□ -0.67
PRP45P28004 ELP4YPL101W 1371 nt10.84□□□□□ -0.67
PRP45P28004 YMR166CYMR166C 1107 nt10.83□□□□□ -0.68
PRP45P28004 SRP54YPR088C 1626 nt10.81□□□□□ -0.68
PRP45P28004 ADE1YAR015W 921 nt10.81□□□□□ -0.68
PRP45P28004 FUS3YBL016W 1062 nt10.81□□□□□ -0.68
PRP45P28004 MET1YKR069W 1782 nt10.8□□□□□ -0.68
PRP45P28004 YKL053WYKL053W 375 nt10.79□□□□□ -0.68
PRP45P28004 PET494YNR045W 1470 nt10.79□□□□□ -0.68
PRP45P28004 YJL043WYJL043W 774 nt10.78□□□□□ -0.68
PRP45P28004 YER156CYER156C 1017 nt10.77□□□□□ -0.69
PRP45P28004 YLR046CYLR046C 813 nt10.76□□□□□ -0.69
PRP45P28004 PBP1YGR178C 2169 nt10.76□□□□□ -0.69
PRP45P28004 RRT14YIL127C 621 nt10.75□□□□□ -0.69
PRP45P28004 SUV3YPL029W 2214 nt10.74□□□□□ -0.69
PRP45P28004 YPT11YNL304W 1254 nt10.73□□□□□ -0.69
PRP45P28004 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt10.72□□□□□ -0.69
PRP45P28004 COS10YNR075W 1125 nt10.71□□□□□ -0.69
PRP45P28004 snR31snR31 225 nt10.71□□□□□ -0.69
PRP45P28004 ALG12YNR030W 1656 nt10.69□□□□□ -0.7
PRP45P28004 KGD2YDR148C 1392 nt10.69□□□□□ -0.7
PRP45P28004 RPR1RPR1 369 nt10.69□□□□□ -0.7
PRP45P28004 SAN1YDR143C 1833 nt10.68□□□□□ -0.7
PRP45P28004 CAK1YFL029C 1107 nt10.68□□□□□ -0.7
PRP45P28004 CCT2YIL142W 1584 nt10.67□□□□□ -0.7
PRP45P28004 ITR2YOL103W 1830 nt10.67□□□□□ -0.7
PRP45P28004 NUP53YMR153W 1428 nt10.66□□□□□ -0.7
PRP45P28004 RSM7YJR113C 744 nt10.65□□□□□ -0.7
PRP45P28004 CRC1YOR100C 984 nt10.65□□□□□ -0.7
PRP45P28004 TDH1YJL052W 999 nt10.64□□□□□ -0.71
PRP45P28004 HAP5YOR358W 729 nt10.64□□□□□ -0.71
PRP45P28004 RPS6AYPL090C 711 nt10.63□□□□□ -0.71
PRP45P28004 RPS6BYBR181C 711 nt10.63□□□□□ -0.71
PRP45P28004 YMR265CYMR265C 1386 nt10.62□□□□□ -0.71
PRP45P28004 YPR084WYPR084W 1371 nt10.62□□□□□ -0.71
PRP45P28004 OCH1YGL038C 1443 nt10.61□□□□□ -0.71
PRP45P28004 BXI1YNL305C 894 nt10.61□□□□□ -0.71
PRP45P28004 YBL095WYBL095W 813 nt10.61□□□□□ -0.71
PRP45P28004 YOR325WYOR325W 474 nt10.6□□□□□ -0.71
PRP45P28004 DLD3YEL071W 1491 nt10.6□□□□□ -0.71
PRP45P28004 CYT2YKL087C 675 nt10.59□□□□□ -0.71
PRP45P28004 OPI10YOL032W 741 nt10.58□□□□□ -0.72
PRP45P28004 RPN14YGL004C 1254 nt10.57□□□□□ -0.72
PRP45P28004 YLR460CYLR460C 1131 nt10.56□□□□□ -0.72
PRP45P28004 ATP2YJR121W 1536 nt10.56□□□□□ -0.72
PRP45P28004 GAS1YMR307W 1680 nt10.56□□□□□ -0.72
PRP45P28004 PTC6YCR079W 1329 nt10.56□□□□□ -0.72
PRP45P28004 MET22YOL064C 1074 nt10.55□□□□□ -0.72
PRP45P28004 ILV3YJR016C 1758 nt10.53□□□□□ -0.72
PRP45P28004 INA1YLR413W 2028 nt10.51□□□□□ -0.73
PRP45P28004 YHR219WYHR219W 1875 nt10.51□□□□□ -0.73
PRP45P28004 CHS7YHR142W 951 nt10.51□□□□□ -0.73
PRP45P28004 YDR476CYDR476C 675 nt10.5□□□□□ -0.73
PRP45P28004 PDC6YGR087C 1692 nt10.48□□□□□ -0.73
PRP45P28004 RRT6YGL146C 936 nt10.48□□□□□ -0.73
PRP45P28004 YAT1YAR035W 2064 nt10.48□□□□□ -0.73
PRP45P28004 PUP2YGR253C 783 nt10.47□□□□□ -0.73
PRP45P28004 YIL168WYIL168W 384 nt10.47□□□□□ -0.73
PRP45P28004 YLR358CYLR358C 564 nt10.47□□□□□ -0.73
PRP45P28004 YML079WYML079W 606 nt10.47□□□□□ -0.73
PRP45P28004 VMA11YPL234C 495 nt10.47□□□□□ -0.73
PRP45P28004 RPC82YPR190C 1965 nt10.46□□□□□ -0.73
PRP45P28004 SBP1YHL034C 885 nt10.45□□□□□ -0.74
PRP45P28004 URA1YKL216W 945 nt10.45□□□□□ -0.74
PRP45P28004 NAR1YNL240C 1476 nt10.44□□□□□ -0.74
PRP45P28004 DOC1YGL240W 753 nt10.42□□□□□ -0.74
PRP45P28004 OLA1YBR025C 1185 nt10.42□□□□□ -0.74
PRP45P28004 RNA170RNA170 169 nt10.41□□□□□ -0.74
PRP45P28004 LSR1LSR1 1175 nt10.41□□□□□ -0.74
PRP45P28004 YPT31YER031C 672 nt10.4□□□□□ -0.74
PRP45P28004 SNX3YOR357C 489 nt10.4□□□□□ -0.74
PRP45P28004 GID8YMR135C 1368 nt10.38□□□□□ -0.75
PRP45P28004 PSP2YML017W 1782 nt10.36□□□□□ -0.75
PRP45P28004 ARO8YGL202W 1503 nt10.35□□□□□ -0.75
PRP45P28004 HAC1YFL031W 717 nt10.35□□□□□ -0.75
PRP45P28004 SPG1YGR236C 288 nt10.33□□□□□ -0.76
PRP45P28004 LAT1YNL071W 1449 nt10.33□□□□□ -0.76
PRP45P28004 MRS6YOR370C 1812 nt10.31□□□□□ -0.76
PRP45P28004 YOR111WYOR111W 699 nt10.31□□□□□ -0.76
PRP45P28004 YKL133CYKL133C 1392 nt10.3□□□□□ -0.76
PRP45P28004 SLM3YDL033C 1254 nt10.3□□□□□ -0.76
PRP45P28004 YJL144WYJL144W 315 nt10.3□□□□□ -0.76
PRP45P28004 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt10.29□□□□□ -0.76
PRP45P28004 SRY1YKL218C 981 nt10.29□□□□□ -0.76
PRP45P28004 RHO1YPR165W 630 nt10.29□□□□□ -0.76
PRP45P28004 PIH1YHR034C 1035 nt10.28□□□□□ -0.76
PRP45P28004 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt10.28□□□□□ -0.76
PRP45P28004 RPD3YNL330C 1302 nt10.27□□□□□ -0.77
PRP45P28004 MUP1YGR055W 1725 nt10.26□□□□□ -0.77
PRP45P28004 CPT1YNL130C 1182 nt10.24□□□□□ -0.77
PRP45P28004 KES1YPL145C 1305 nt10.24□□□□□ -0.77
PRP45P28004 NCA3YJL116C 1014 nt10.23□□□□□ -0.77
PRP45P28004 YOX1YML027W 1158 nt10.23□□□□□ -0.77
PRP45P28004 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt10.22□□□□□ -0.77
PRP45P28004 YIR035CYIR035C 765 nt10.21□□□□□ -0.77
PRP45P28004 PMU1YKL128C 888 nt10.21□□□□□ -0.77
PRP45P28004 THI73YLR004C 1572 nt10.21□□□□□ -0.78
PRP45P28004 PNS1YOR161C 1620 nt10.21□□□□□ -0.78
PRP45P28004 JHD1YER051W 1479 nt10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.7 ms