Protein–RNA interactions for Protein: P22090

RPS4Y1, 40S ribosomal protein S4, Y isoform 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4Y1P22090 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS4Y1P22090 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS4Y1P22090 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS4Y1P22090 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS4Y1P22090 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS4Y1P22090 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS4Y1P22090 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS4Y1P22090 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS4Y1P22090 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS4Y1P22090 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS4Y1P22090 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS4Y1P22090 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS4Y1P22090 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS4Y1P22090 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS4Y1P22090 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS4Y1P22090 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS4Y1P22090 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS4Y1P22090 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS4Y1P22090 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS4Y1P22090 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS4Y1P22090 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS4Y1P22090 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS4Y1P22090 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS4Y1P22090 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS4Y1P22090 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS4Y1P22090 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS4Y1P22090 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS4Y1P22090 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS4Y1P22090 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS4Y1P22090 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS4Y1P22090 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS4Y1P22090 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS4Y1P22090 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPS4Y1P22090 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS4Y1P22090 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS4Y1P22090 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS4Y1P22090 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS4Y1P22090 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS4Y1P22090 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS4Y1P22090 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS4Y1P22090 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS4Y1P22090 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS4Y1P22090 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS4Y1P22090 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS4Y1P22090 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS4Y1P22090 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS4Y1P22090 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS4Y1P22090 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPS4Y1P22090 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPS4Y1P22090 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPS4Y1P22090 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPS4Y1P22090 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPS4Y1P22090 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPS4Y1P22090 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPS4Y1P22090 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS4Y1P22090 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS4Y1P22090 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS4Y1P22090 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS4Y1P22090 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS4Y1P22090 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS4Y1P22090 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS4Y1P22090 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS4Y1P22090 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS4Y1P22090 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS4Y1P22090 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS4Y1P22090 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS4Y1P22090 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS4Y1P22090 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS4Y1P22090 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS4Y1P22090 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS4Y1P22090 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS4Y1P22090 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS4Y1P22090 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS4Y1P22090 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS4Y1P22090 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS4Y1P22090 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS4Y1P22090 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS4Y1P22090 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS4Y1P22090 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS4Y1P22090 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS4Y1P22090 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS4Y1P22090 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS4Y1P22090 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS4Y1P22090 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS4Y1P22090 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS4Y1P22090 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS4Y1P22090 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS4Y1P22090 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS4Y1P22090 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS4Y1P22090 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS4Y1P22090 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS4Y1P22090 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS4Y1P22090 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS4Y1P22090 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS4Y1P22090 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS4Y1P22090 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS4Y1P22090 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS4Y1P22090 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPS4Y1P22090 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPS4Y1P22090 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms