Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA5P20719 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA5P20719 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA5P20719 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA5P20719 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA5P20719 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA5P20719 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA5P20719 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA5P20719 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA5P20719 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA5P20719 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA5P20719 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA5P20719 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA5P20719 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA5P20719 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA5P20719 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA5P20719 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA5P20719 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA5P20719 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA5P20719 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA5P20719 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA5P20719 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA5P20719 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA5P20719 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA5P20719 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA5P20719 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA5P20719 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA5P20719 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA5P20719 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA5P20719 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA5P20719 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA5P20719 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA5P20719 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA5P20719 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA5P20719 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA5P20719 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA5P20719 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA5P20719 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA5P20719 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA5P20719 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXA5P20719 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA5P20719 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA5P20719 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA5P20719 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA5P20719 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA5P20719 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA5P20719 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA5P20719 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA5P20719 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA5P20719 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA5P20719 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA5P20719 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA5P20719 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA5P20719 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA5P20719 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA5P20719 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA5P20719 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA5P20719 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA5P20719 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA5P20719 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA5P20719 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA5P20719 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA5P20719 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA5P20719 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA5P20719 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA5P20719 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA5P20719 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA5P20719 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA5P20719 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA5P20719 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA5P20719 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA5P20719 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA5P20719 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA5P20719 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA5P20719 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA5P20719 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA5P20719 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA5P20719 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA5P20719 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA5P20719 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA5P20719 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA5P20719 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA5P20719 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA5P20719 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA5P20719 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA5P20719 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA5P20719 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA5P20719 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA5P20719 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA5P20719 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA5P20719 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
HOXA5P20719 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms