Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
THRAP10827 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
THRAP10827 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THRAP10827 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
THRAP10827 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
THRAP10827 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
THRAP10827 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
THRAP10827 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
THRAP10827 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
THRAP10827 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
THRAP10827 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
THRAP10827 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
THRAP10827 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
THRAP10827 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THRAP10827 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THRAP10827 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THRAP10827 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
THRAP10827 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
THRAP10827 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THRAP10827 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
THRAP10827 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THRAP10827 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THRAP10827 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THRAP10827 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THRAP10827 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
THRAP10827 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
THRAP10827 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
THRAP10827 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
THRAP10827 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
THRAP10827 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
THRAP10827 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
THRAP10827 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
THRAP10827 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
THRAP10827 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
THRAP10827 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
THRAP10827 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
THRAP10827 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
THRAP10827 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
THRAP10827 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
THRAP10827 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
THRAP10827 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THRAP10827 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
THRAP10827 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
THRAP10827 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
THRAP10827 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
THRAP10827 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
THRAP10827 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
THRAP10827 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
THRAP10827 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
THRAP10827 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
THRAP10827 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
THRAP10827 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
THRAP10827 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
THRAP10827 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
THRAP10827 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
THRAP10827 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
THRAP10827 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
THRAP10827 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
THRAP10827 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
THRAP10827 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
THRAP10827 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
THRAP10827 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
THRAP10827 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
THRAP10827 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
THRAP10827 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
THRAP10827 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
THRAP10827 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
THRAP10827 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
THRAP10827 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
THRAP10827 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
THRAP10827 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
THRAP10827 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
THRAP10827 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
THRAP10827 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
THRAP10827 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
THRAP10827 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
THRAP10827 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THRAP10827 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
THRAP10827 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THRAP10827 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
THRAP10827 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THRAP10827 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THRAP10827 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THRAP10827 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THRAP10827 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
THRAP10827 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
THRAP10827 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
THRAP10827 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THRAP10827 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THRAP10827 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
THRAP10827 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
THRAP10827 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
THRAP10827 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
THRAP10827 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
THRAP10827 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
THRAP10827 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
THRAP10827 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
THRAP10827 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
THRAP10827 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
THRAP10827 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms