Protein–RNA interactions for Protein: P04085

PDGFA, Platelet-derived growth factor subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFAP04085 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFAP04085 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFAP04085 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFAP04085 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFAP04085 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFAP04085 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFAP04085 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFAP04085 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFAP04085 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFAP04085 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFAP04085 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFAP04085 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFAP04085 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFAP04085 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFAP04085 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFAP04085 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFAP04085 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFAP04085 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFAP04085 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFAP04085 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFAP04085 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFAP04085 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFAP04085 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFAP04085 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFAP04085 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFAP04085 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFAP04085 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFAP04085 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFAP04085 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFAP04085 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFAP04085 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFAP04085 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFAP04085 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFAP04085 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFAP04085 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFAP04085 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFAP04085 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFAP04085 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFAP04085 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFAP04085 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFAP04085 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFAP04085 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFAP04085 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFAP04085 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFAP04085 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDGFAP04085 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDGFAP04085 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDGFAP04085 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFAP04085 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFAP04085 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFAP04085 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFAP04085 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFAP04085 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFAP04085 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFAP04085 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFAP04085 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFAP04085 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFAP04085 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFAP04085 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFAP04085 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFAP04085 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFAP04085 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFAP04085 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFAP04085 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFAP04085 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFAP04085 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFAP04085 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFAP04085 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFAP04085 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFAP04085 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFAP04085 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFAP04085 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFAP04085 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFAP04085 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFAP04085 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFAP04085 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFAP04085 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFAP04085 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFAP04085 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFAP04085 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFAP04085 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFAP04085 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFAP04085 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFAP04085 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFAP04085 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFAP04085 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFAP04085 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFAP04085 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFAP04085 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFAP04085 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFAP04085 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFAP04085 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFAP04085 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFAP04085 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFAP04085 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFAP04085 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFAP04085 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFAP04085 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFAP04085 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFAP04085 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms