Protein–RNA interactions for Protein: P01732

CD8A, T-cell surface glycoprotein CD8 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8AP01732 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD8AP01732 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD8AP01732 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD8AP01732 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD8AP01732 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD8AP01732 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD8AP01732 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD8AP01732 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD8AP01732 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD8AP01732 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD8AP01732 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD8AP01732 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD8AP01732 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD8AP01732 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD8AP01732 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD8AP01732 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD8AP01732 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD8AP01732 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD8AP01732 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD8AP01732 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD8AP01732 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD8AP01732 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD8AP01732 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD8AP01732 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD8AP01732 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD8AP01732 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD8AP01732 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD8AP01732 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD8AP01732 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD8AP01732 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD8AP01732 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD8AP01732 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD8AP01732 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD8AP01732 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD8AP01732 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD8AP01732 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD8AP01732 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD8AP01732 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD8AP01732 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD8AP01732 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CD8AP01732 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD8AP01732 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD8AP01732 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD8AP01732 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CD8AP01732 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CD8AP01732 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CD8AP01732 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD8AP01732 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD8AP01732 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD8AP01732 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CD8AP01732 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CD8AP01732 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CD8AP01732 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD8AP01732 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD8AP01732 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD8AP01732 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD8AP01732 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD8AP01732 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CD8AP01732 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD8AP01732 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD8AP01732 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD8AP01732 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD8AP01732 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CD8AP01732 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD8AP01732 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD8AP01732 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD8AP01732 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD8AP01732 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD8AP01732 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD8AP01732 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD8AP01732 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD8AP01732 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD8AP01732 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD8AP01732 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD8AP01732 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD8AP01732 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD8AP01732 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD8AP01732 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD8AP01732 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD8AP01732 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD8AP01732 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD8AP01732 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD8AP01732 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD8AP01732 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD8AP01732 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CD8AP01732 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD8AP01732 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD8AP01732 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD8AP01732 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD8AP01732 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD8AP01732 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD8AP01732 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD8AP01732 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD8AP01732 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD8AP01732 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD8AP01732 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD8AP01732 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD8AP01732 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD8AP01732 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD8AP01732 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms