Protein–RNA interactions for Protein: O95996

APC2, Adenomatous polyposis coli protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APC2O95996 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
APC2O95996 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APC2O95996 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APC2O95996 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APC2O95996 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APC2O95996 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APC2O95996 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APC2O95996 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APC2O95996 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
APC2O95996 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APC2O95996 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APC2O95996 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APC2O95996 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APC2O95996 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APC2O95996 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APC2O95996 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APC2O95996 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APC2O95996 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APC2O95996 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APC2O95996 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APC2O95996 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APC2O95996 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APC2O95996 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APC2O95996 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
APC2O95996 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APC2O95996 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APC2O95996 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APC2O95996 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APC2O95996 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APC2O95996 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APC2O95996 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APC2O95996 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APC2O95996 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APC2O95996 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APC2O95996 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APC2O95996 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APC2O95996 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APC2O95996 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APC2O95996 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
APC2O95996 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
APC2O95996 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APC2O95996 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
APC2O95996 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APC2O95996 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APC2O95996 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
APC2O95996 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APC2O95996 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APC2O95996 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APC2O95996 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APC2O95996 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APC2O95996 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APC2O95996 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
APC2O95996 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APC2O95996 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
APC2O95996 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
APC2O95996 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APC2O95996 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APC2O95996 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APC2O95996 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
APC2O95996 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APC2O95996 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APC2O95996 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APC2O95996 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APC2O95996 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APC2O95996 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
APC2O95996 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APC2O95996 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APC2O95996 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APC2O95996 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APC2O95996 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
APC2O95996 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APC2O95996 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APC2O95996 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APC2O95996 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APC2O95996 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
APC2O95996 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APC2O95996 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APC2O95996 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APC2O95996 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APC2O95996 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APC2O95996 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APC2O95996 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APC2O95996 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
APC2O95996 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APC2O95996 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APC2O95996 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APC2O95996 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APC2O95996 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APC2O95996 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APC2O95996 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APC2O95996 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APC2O95996 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APC2O95996 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APC2O95996 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APC2O95996 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APC2O95996 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APC2O95996 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APC2O95996 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APC2O95996 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APC2O95996 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms