Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN13O95857 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN13O95857 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN13O95857 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN13O95857 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN13O95857 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN13O95857 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN13O95857 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN13O95857 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN13O95857 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN13O95857 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN13O95857 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN13O95857 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN13O95857 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN13O95857 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN13O95857 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSPAN13O95857 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSPAN13O95857 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSPAN13O95857 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSPAN13O95857 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSPAN13O95857 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSPAN13O95857 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN13O95857 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN13O95857 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN13O95857 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN13O95857 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN13O95857 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN13O95857 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN13O95857 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN13O95857 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN13O95857 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN13O95857 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN13O95857 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN13O95857 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN13O95857 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN13O95857 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN13O95857 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN13O95857 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSPAN13O95857 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSPAN13O95857 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSPAN13O95857 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSPAN13O95857 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TSPAN13O95857 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSPAN13O95857 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSPAN13O95857 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSPAN13O95857 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSPAN13O95857 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSPAN13O95857 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSPAN13O95857 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSPAN13O95857 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSPAN13O95857 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSPAN13O95857 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSPAN13O95857 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSPAN13O95857 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSPAN13O95857 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSPAN13O95857 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSPAN13O95857 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSPAN13O95857 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSPAN13O95857 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSPAN13O95857 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSPAN13O95857 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSPAN13O95857 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSPAN13O95857 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSPAN13O95857 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSPAN13O95857 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSPAN13O95857 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSPAN13O95857 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TSPAN13O95857 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSPAN13O95857 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSPAN13O95857 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSPAN13O95857 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSPAN13O95857 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSPAN13O95857 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSPAN13O95857 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSPAN13O95857 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSPAN13O95857 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSPAN13O95857 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSPAN13O95857 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSPAN13O95857 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSPAN13O95857 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TSPAN13O95857 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSPAN13O95857 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSPAN13O95857 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSPAN13O95857 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSPAN13O95857 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSPAN13O95857 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSPAN13O95857 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSPAN13O95857 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSPAN13O95857 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSPAN13O95857 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TSPAN13O95857 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TSPAN13O95857 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TSPAN13O95857 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TSPAN13O95857 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TSPAN13O95857 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TSPAN13O95857 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TSPAN13O95857 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TSPAN13O95857 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TSPAN13O95857 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TSPAN13O95857 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms