Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNAPINO95295 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms