Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNAPINO95295 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAPINO95295 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNAPINO95295 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNAPINO95295 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAPINO95295 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms