Protein–RNA interactions for Protein: O43435

TBX1, T-box transcription factor TBX1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX1O43435 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBX1O43435 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBX1O43435 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TBX1O43435 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBX1O43435 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX1O43435 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX1O43435 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX1O43435 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX1O43435 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBX1O43435 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBX1O43435 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBX1O43435 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBX1O43435 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX1O43435 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX1O43435 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX1O43435 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX1O43435 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX1O43435 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX1O43435 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX1O43435 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX1O43435 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX1O43435 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX1O43435 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX1O43435 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX1O43435 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX1O43435 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBX1O43435 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBX1O43435 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TBX1O43435 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBX1O43435 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBX1O43435 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBX1O43435 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX1O43435 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX1O43435 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX1O43435 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX1O43435 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBX1O43435 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBX1O43435 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBX1O43435 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TBX1O43435 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBX1O43435 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBX1O43435 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBX1O43435 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBX1O43435 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBX1O43435 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBX1O43435 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBX1O43435 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBX1O43435 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBX1O43435 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBX1O43435 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TBX1O43435 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBX1O43435 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBX1O43435 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBX1O43435 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBX1O43435 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBX1O43435 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBX1O43435 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBX1O43435 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TBX1O43435 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TBX1O43435 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TBX1O43435 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBX1O43435 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBX1O43435 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBX1O43435 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBX1O43435 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBX1O43435 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBX1O43435 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBX1O43435 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBX1O43435 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBX1O43435 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBX1O43435 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBX1O43435 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBX1O43435 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TBX1O43435 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TBX1O43435 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TBX1O43435 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBX1O43435 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBX1O43435 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBX1O43435 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBX1O43435 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBX1O43435 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBX1O43435 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBX1O43435 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBX1O43435 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBX1O43435 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBX1O43435 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBX1O43435 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBX1O43435 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBX1O43435 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBX1O43435 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBX1O43435 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBX1O43435 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBX1O43435 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBX1O43435 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBX1O43435 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBX1O43435 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBX1O43435 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBX1O43435 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBX1O43435 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TBX1O43435 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms