Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMA5O15230 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMA5O15230 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMA5O15230 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMA5O15230 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMA5O15230 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMA5O15230 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMA5O15230 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMA5O15230 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMA5O15230 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA5O15230 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA5O15230 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMA5O15230 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMA5O15230 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMA5O15230 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMA5O15230 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMA5O15230 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMA5O15230 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA5O15230 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA5O15230 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA5O15230 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA5O15230 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA5O15230 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA5O15230 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA5O15230 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA5O15230 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA5O15230 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA5O15230 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA5O15230 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA5O15230 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA5O15230 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA5O15230 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA5O15230 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA5O15230 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA5O15230 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMA5O15230 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMA5O15230 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMA5O15230 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMA5O15230 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMA5O15230 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMA5O15230 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA5O15230 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA5O15230 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA5O15230 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA5O15230 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA5O15230 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA5O15230 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA5O15230 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA5O15230 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA5O15230 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA5O15230 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA5O15230 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA5O15230 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA5O15230 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA5O15230 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA5O15230 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA5O15230 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA5O15230 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA5O15230 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA5O15230 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA5O15230 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMA5O15230 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA5O15230 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA5O15230 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA5O15230 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA5O15230 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA5O15230 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMA5O15230 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMA5O15230 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMA5O15230 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMA5O15230 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMA5O15230 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMA5O15230 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMA5O15230 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMA5O15230 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMA5O15230 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMA5O15230 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMA5O15230 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMA5O15230 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMA5O15230 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMA5O15230 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMA5O15230 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMA5O15230 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA5O15230 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA5O15230 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA5O15230 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA5O15230 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA5O15230 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA5O15230 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA5O15230 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA5O15230 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA5O15230 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA5O15230 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA5O15230 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA5O15230 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA5O15230 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA5O15230 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA5O15230 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMA5O15230 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMA5O15230 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms