Protein–RNA interactions for Protein: O00548

DLL1, Delta-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL1O00548 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DLL1O00548 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DLL1O00548 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DLL1O00548 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DLL1O00548 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DLL1O00548 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DLL1O00548 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DLL1O00548 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DLL1O00548 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DLL1O00548 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DLL1O00548 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DLL1O00548 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DLL1O00548 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DLL1O00548 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DLL1O00548 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DLL1O00548 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DLL1O00548 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DLL1O00548 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DLL1O00548 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DLL1O00548 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DLL1O00548 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
DLL1O00548 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
DLL1O00548 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DLL1O00548 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DLL1O00548 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DLL1O00548 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DLL1O00548 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DLL1O00548 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DLL1O00548 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DLL1O00548 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DLL1O00548 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DLL1O00548 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DLL1O00548 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DLL1O00548 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DLL1O00548 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.56■■■□□ 2
DLL1O00548 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
DLL1O00548 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
DLL1O00548 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.54■■■□□ 2
DLL1O00548 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
DLL1O00548 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DLL1O00548 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DLL1O00548 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DLL1O00548 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
DLL1O00548 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
DLL1O00548 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DLL1O00548 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DLL1O00548 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DLL1O00548 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DLL1O00548 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DLL1O00548 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DLL1O00548 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DLL1O00548 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DLL1O00548 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DLL1O00548 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DLL1O00548 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DLL1O00548 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DLL1O00548 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DLL1O00548 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DLL1O00548 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DLL1O00548 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DLL1O00548 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DLL1O00548 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DLL1O00548 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DLL1O00548 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DLL1O00548 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DLL1O00548 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DLL1O00548 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DLL1O00548 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DLL1O00548 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DLL1O00548 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DLL1O00548 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DLL1O00548 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
DLL1O00548 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DLL1O00548 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DLL1O00548 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DLL1O00548 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DLL1O00548 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DLL1O00548 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DLL1O00548 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DLL1O00548 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DLL1O00548 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DLL1O00548 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DLL1O00548 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DLL1O00548 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DLL1O00548 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DLL1O00548 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DLL1O00548 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DLL1O00548 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DLL1O00548 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DLL1O00548 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DLL1O00548 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DLL1O00548 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DLL1O00548 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DLL1O00548 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DLL1O00548 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DLL1O00548 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DLL1O00548 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DLL1O00548 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DLL1O00548 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DLL1O00548 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms