Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEMP2A6NFY4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NEMP2A6NFY4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEMP2A6NFY4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEMP2A6NFY4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEMP2A6NFY4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEMP2A6NFY4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEMP2A6NFY4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEMP2A6NFY4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEMP2A6NFY4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEMP2A6NFY4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEMP2A6NFY4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NEMP2A6NFY4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEMP2A6NFY4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEMP2A6NFY4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEMP2A6NFY4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEMP2A6NFY4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEMP2A6NFY4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEMP2A6NFY4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEMP2A6NFY4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEMP2A6NFY4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEMP2A6NFY4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEMP2A6NFY4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEMP2A6NFY4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEMP2A6NFY4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEMP2A6NFY4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEMP2A6NFY4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEMP2A6NFY4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEMP2A6NFY4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEMP2A6NFY4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEMP2A6NFY4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEMP2A6NFY4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEMP2A6NFY4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEMP2A6NFY4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEMP2A6NFY4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEMP2A6NFY4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEMP2A6NFY4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEMP2A6NFY4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEMP2A6NFY4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEMP2A6NFY4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEMP2A6NFY4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NEMP2A6NFY4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEMP2A6NFY4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NEMP2A6NFY4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEMP2A6NFY4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEMP2A6NFY4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
NEMP2A6NFY4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEMP2A6NFY4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEMP2A6NFY4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEMP2A6NFY4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NEMP2A6NFY4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEMP2A6NFY4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEMP2A6NFY4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEMP2A6NFY4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEMP2A6NFY4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEMP2A6NFY4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NEMP2A6NFY4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEMP2A6NFY4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NEMP2A6NFY4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEMP2A6NFY4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEMP2A6NFY4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEMP2A6NFY4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEMP2A6NFY4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NEMP2A6NFY4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NEMP2A6NFY4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NEMP2A6NFY4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEMP2A6NFY4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEMP2A6NFY4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEMP2A6NFY4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEMP2A6NFY4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEMP2A6NFY4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEMP2A6NFY4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEMP2A6NFY4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEMP2A6NFY4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEMP2A6NFY4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEMP2A6NFY4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEMP2A6NFY4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEMP2A6NFY4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NEMP2A6NFY4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEMP2A6NFY4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEMP2A6NFY4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEMP2A6NFY4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEMP2A6NFY4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEMP2A6NFY4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEMP2A6NFY4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEMP2A6NFY4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEMP2A6NFY4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEMP2A6NFY4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEMP2A6NFY4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEMP2A6NFY4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEMP2A6NFY4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEMP2A6NFY4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEMP2A6NFY4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEMP2A6NFY4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEMP2A6NFY4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEMP2A6NFY4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEMP2A6NFY4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEMP2A6NFY4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEMP2A6NFY4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEMP2A6NFY4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.4 ms