Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Fam71e1A1L3C1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Fam71e1A1L3C1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Fam71e1A1L3C1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Fam71e1A1L3C1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Fam71e1A1L3C1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Fam71e1A1L3C1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Fam71e1A1L3C1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Fam71e1A1L3C1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Fam71e1A1L3C1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Fam71e1A1L3C1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Fam71e1A1L3C1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Fam71e1A1L3C1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Fam71e1A1L3C1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Fam71e1A1L3C1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Fam71e1A1L3C1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Fam71e1A1L3C1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Fam71e1A1L3C1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Fam71e1A1L3C1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Fam71e1A1L3C1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Fam71e1A1L3C1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Fam71e1A1L3C1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Fam71e1A1L3C1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Fam71e1A1L3C1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Fam71e1A1L3C1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Fam71e1A1L3C1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Fam71e1A1L3C1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Fam71e1A1L3C1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Fam71e1A1L3C1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Fam71e1A1L3C1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Fam71e1A1L3C1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Fam71e1A1L3C1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Fam71e1A1L3C1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Fam71e1A1L3C1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Fam71e1A1L3C1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Fam71e1A1L3C1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Fam71e1A1L3C1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Fam71e1A1L3C1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Fam71e1A1L3C1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Fam71e1A1L3C1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Fam71e1A1L3C1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Fam71e1A1L3C1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Fam71e1A1L3C1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Fam71e1A1L3C1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Fam71e1A1L3C1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Fam71e1A1L3C1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Fam71e1A1L3C1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Fam71e1A1L3C1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Fam71e1A1L3C1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Fam71e1A1L3C1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Fam71e1A1L3C1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Fam71e1A1L3C1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Fam71e1A1L3C1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Fam71e1A1L3C1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Fam71e1A1L3C1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Fam71e1A1L3C1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Fam71e1A1L3C1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Fam71e1A1L3C1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Fam71e1A1L3C1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Fam71e1A1L3C1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Fam71e1A1L3C1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Fam71e1A1L3C1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Fam71e1A1L3C1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Fam71e1A1L3C1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Fam71e1A1L3C1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Fam71e1A1L3C1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Fam71e1A1L3C1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Fam71e1A1L3C1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Fam71e1A1L3C1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Fam71e1A1L3C1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Fam71e1A1L3C1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Fam71e1A1L3C1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Fam71e1A1L3C1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Fam71e1A1L3C1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Fam71e1A1L3C1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Fam71e1A1L3C1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Fam71e1A1L3C1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Fam71e1A1L3C1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Fam71e1A1L3C1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Fam71e1A1L3C1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Fam71e1A1L3C1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Fam71e1A1L3C1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Fam71e1A1L3C1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Fam71e1A1L3C1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Fam71e1A1L3C1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Fam71e1A1L3C1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Fam71e1A1L3C1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Fam71e1A1L3C1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Fam71e1A1L3C1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Fam71e1A1L3C1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Fam71e1A1L3C1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Fam71e1A1L3C1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Fam71e1A1L3C1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Fam71e1A1L3C1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Fam71e1A1L3C1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Fam71e1A1L3C1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Fam71e1A1L3C1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Fam71e1A1L3C1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Fam71e1A1L3C1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Fam71e1A1L3C1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms