Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC135068.4-201ENST00000622949 925 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 RMDN2-AS1-210ENST00000630021 1053 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC106882.1-201ENST00000515789 2371 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 OR1M1-202ENST00000641627 2535 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 FARSB-201ENST00000281828 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 SLC6A16-202ENST00000454748 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 PARP2-201ENST00000250416 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 IL18RAP-202ENST00000409369 1890 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 TRIM64EP-201ENST00000531233 1307 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 TNFRSF19-203ENST00000382263 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 LGI1-211ENST00000630047 1751 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 ANAPC5-204ENST00000441917 2147 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 KDM4C-205ENST00000428870 3039 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 LINC00222-203ENST00000416890 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AL162582.1-201ENST00000419196 467 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 VDAC1P2-201ENST00000423609 850 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC114752.2-201ENST00000424119 404 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 FTLP17-201ENST00000432567 525 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 LINC01832-201ENST00000446520 553 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 IGKV1OR2-2-201ENST00000451163 355 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 HSPD1P4-201ENST00000547203 1702 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC060809.1-201ENST00000559211 564 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC068724.2-201ENST00000565685 532 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC007861.1-201ENST00000576671 674 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC006441.4-202ENST00000577621 510 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC068802.1-201ENST00000603420 732 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC016747.2-203ENST00000606876 289 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AL353753.1-201ENST00000612217 2320 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AL049536.1-202ENST00000623572 455 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC022743.1-201ENST00000624990 664 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 SLFN12L-201ENST00000260908 3119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 OR10W1-201ENST00000395079 1469 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 ALB-203ENST00000415165 1483 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 TPD52-204ENST00000517427 2596 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 PBLD-203ENST00000336578 2449 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC091544.5-201ENST00000620192 3815 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 NRXN1-206ENST00000402717 2508 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 BBOX1-201ENST00000263182 1886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 SLC16A4-202ENST00000369781 2082 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC004672.1-201ENST00000513082 2088 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 PSORS1C1-201ENST00000259881 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 DEFB119-201ENST00000339144 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms