Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AL136298.2-201ENST00000556497 1570 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AC104958.1-201ENST00000509350 1973 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 TFDP2-222ENST00000495310 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 SNORA70.8-201ENST00000384231 136 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AC113608.1-201ENST00000398740 305 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 C21orf140-201ENST00000410005 756 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AP001043.1-203ENST00000415824 407 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 TRBV30-201ENST00000417977 447 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AL627308.2-201ENST00000420014 432 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AC073367.1-201ENST00000421480 697 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 FDPSP6-201ENST00000425091 512 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AL031963.2-201ENST00000433761 398 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 RPS10P3-201ENST00000439253 494 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AC008026.1-201ENST00000460492 447 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 TAAR3P-201ENST00000466706 1078 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 IGKV2OR22-4-201ENST00000523309 367 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 LINC00958-202ENST00000526388 607 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AP003499.1-201ENST00000527217 574 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 PPIAL4D-201ENST00000544708 495 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 SNHG1-223ENST00000545440 754 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 TTN-AS1-215ENST00000585451 949 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AC010761.6-201ENST00000587898 197 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AL121985.1-203ENST00000588034 556 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AC003002.3-201ENST00000597410 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AC010519.1-201ENST00000599924 344 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AC008385.1-201ENST00000604421 355 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 FAM228B-205ENST00000611127 975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AL353898.2-201ENST00000623000 255 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AC079456.1-201ENST00000624010 480 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 STN1-202ENST00000369764 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 FBXO3-209ENST00000531080 1448 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 SMR3A-201ENST00000226460 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 RNA5SP483-201ENST00000363431 118 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 RNA5SP472-201ENST00000363868 119 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 RPL12P1-201ENST00000374520 498 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 PSG11-203ENST00000403486 1163 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 NIF3L1-206ENST00000416651 967 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AC012560.1-202ENST00000421324 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 GAPDHP46-201ENST00000424043 994 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 NPM1P30-201ENST00000425092 828 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 ECHDC1-207ENST00000430841 1009 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 CYP2C56P-201ENST00000440076 291 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AC079781.1-201ENST00000441505 394 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 RPSAP49-201ENST00000445182 886 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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