Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ZNF540-202ENST00000343599 3073 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 BPIFC-203ENST00000397452 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 CDY10P-201ENST00000452415 1567 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 DDX42-203ENST00000457800 3323 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 GNG3-201ENST00000294117 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 CLEC1B-202ENST00000348658 869 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 RNA5SP301-201ENST00000362537 121 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC105052.2-201ENST00000434317 794 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 CDK7P1-201ENST00000434574 693 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 LINC01393-202ENST00000435981 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC016396.1-201ENST00000440189 328 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 SNX18P9-201ENST00000440580 835 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC093581.1-204ENST00000442606 390 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AL591122.1-201ENST00000487348 492 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 RASGRF2-AS1-201ENST00000505107 665 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 HMMR-AS1-201ENST00000514724 697 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC022509.1-203ENST00000541940 708 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 LYZ-202ENST00000548839 558 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC026458.1-201ENST00000564330 438 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 CU638689.4-205ENST00000623313 596 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC127071.1-201ENST00000624997 712 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AL160396.1-201ENST00000637433 575 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 RNGTT-203ENST00000538899 1374 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC108676.1-201ENST00000455557 2969 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 RGS5-215ENST00000439699 1441 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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RTL8BQ17RB0 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC090617.1-201ENST00000413674 323 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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RTL8BQ17RB0 AL513164.1-201ENST00000423268 311 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AL033379.1-201ENST00000442184 481 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AL022068.1-208ENST00000447250 1016 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 RN7SL91P-201ENST00000469313 291 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 NSRP1-205ENST00000479218 540 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 GLYATL1P4-201ENST00000529326 906 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 REG4-204ENST00000530654 612 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC027288.1-201ENST00000548359 816 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 NR2F2-AS1-205ENST00000559505 1005 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 INO80-AS1-202ENST00000560178 444 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC006116.6-201ENST00000593258 1103 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AL591686.2-201ENST00000608241 475 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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