Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 RNGTT-203ENST00000538899 1374 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 OR5BK1P-201ENST00000550421 823 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 DTNA-201ENST00000269192 1964 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 ADGRA3-209ENST00000508133 1572 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 TMEM135-202ENST00000340353 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 MEF2C-217ENST00000510942 3446 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 AC007349.3-201ENST00000415356 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 AL162582.1-201ENST00000419196 467 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 CHCHD4P5-201ENST00000436684 427 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 AC027124.1-201ENST00000440852 466 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 PARD3-AS1-201ENST00000446211 302 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 AC068759.1-201ENST00000447709 470 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 AC009948.1-203ENST00000450044 793 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 AC114956.3-202ENST00000505645 482 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 AC097494.1-201ENST00000512898 732 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 AC098487.1-203ENST00000512915 546 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 MTCYBP44-201ENST00000514835 823 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 IGHVII-51-2-201ENST00000519778 259 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 AC022509.1-203ENST00000541940 708 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 IQCK-206ENST00000564186 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 AC117503.3-201ENST00000623811 601 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 SCRN3-201ENST00000272732 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 RBM26-AS1-202ENST00000606049 2427 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 PBLD-204ENST00000358769 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNRPFP62306 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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