Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 MAS1-201ENST00000252660 9841 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 MATR3-232ENST00000502929 4373 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 RNU1-122P-201ENST00000365538 156 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC114928.1-201ENST00000446516 415 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 PMS2P11-201ENST00000451831 574 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 BX323845.2-201ENST00000458382 234 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC013787.1-201ENST00000460165 307 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC079193.1-201ENST00000460497 588 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 TRIM69-204ENST00000558329 1211 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 CR392039.3-201ENST00000623236 227 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC026108.1-201ENST00000635444 547 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 ERG-208ENST00000417133 5023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 CACNB4-263ENST00000637779 1772 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 PARP2-204ENST00000527915 1980 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 ERVFRD-1-202ENST00000542862 3184 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 KIT-201ENST00000288135 5186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 GCSAM-201ENST00000308910 3336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 OR4F15-201ENST00000332238 2119 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 TCF12-206ENST00000543579 1809 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 DCX-206ENST00000496551 1320 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 STK33-201ENST00000315204 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 SCAPER-202ENST00000324767 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AL022163.1-201ENST00000430261 1569 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 GMFB-209ENST00000616146 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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HOXD12P35452 TIMD4-203ENST00000407087 1145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 GSTA10P-201ENST00000412182 576 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AL691515.2-201ENST00000414765 466 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 BACH1-IT2-201ENST00000436529 806 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 HMGB2-202ENST00000438704 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC009237.4-201ENST00000441078 238 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC114488.2-222ENST00000445166 362 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC092570.2-201ENST00000452117 1143 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AL356364.1-201ENST00000458443 182 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 RPL12P40-201ENST00000467028 488 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC108688.1-201ENST00000485817 713 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 RN7SL306P-201ENST00000492941 296 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AP001803.1-201ENST00000525668 147 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 KNTC1-206ENST00000534995 1065 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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