Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC073571.1-201ENST00000549103 475 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC023908.2-201ENST00000558616 318 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 LINC02137-201ENST00000561906 644 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC018554.2-201ENST00000563482 261 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 GTF2IP6-201ENST00000583143 541 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC106037.1-201ENST00000584148 336 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC097376.1-201ENST00000602907 997 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AL356289.1-201ENST00000635446 743 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AL358913.2-201ENST00000553881 1548 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 CASC23-201ENST00000534076 1563 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 ERMARD-205ENST00000418781 1841 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 MS4A6A-208ENST00000528851 1806 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 RN7SKP225-201ENST00000410405 352 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AL691515.2-201ENST00000414765 466 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC011753.4-201ENST00000417974 311 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 EEF1GP7-201ENST00000422983 703 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 MYL6BP1-201ENST00000429485 615 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC002066.1-202ENST00000439070 699 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 MEG8-205ENST00000442197 625 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC092447.7-202ENST00000443198 580 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC009502.2-201ENST00000452903 766 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC114755.1-201ENST00000453101 868 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 DEFA10P-201ENST00000455014 288 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 ASPA-202ENST00000456349 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL395P-201ENST00000462960 291 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 PA2G4P4-201ENST00000473864 1182 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL201P-201ENST00000482306 296 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC008799.2-201ENST00000484429 647 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC096741.2-201ENST00000510225 637 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 LINC01411-204ENST00000510234 938 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 TMEM269-202ENST00000536543 983 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC138907.7-202ENST00000565347 540 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC141257.2-201ENST00000569199 540 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 KCTD2-206ENST00000581589 993 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 LINC01028-201ENST00000586373 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC019080.4-201ENST00000606200 564 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AP005328.2-201ENST00000606879 657 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC009686.2-201ENST00000607017 577 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC133041.1-201ENST00000608389 201 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 VDAC1P8-210ENST00000610068 1251 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 CSTL1-205ENST00000619238 477 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 PFN1P2-202ENST00000621347 397 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 SEPT10-205ENST00000415095 1605 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 RNF14-203ENST00000394514 2905 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HMGB1P1B2RPK0 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms