Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 TCAM1P-205ENST00000478379 3317 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 Z96074.1-203ENST00000637685 1746 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 MIR498-201ENST00000385134 124 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 VDAC1P10-201ENST00000416715 891 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 FDPSP1-201ENST00000424976 1071 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AC104389.2-201ENST00000450768 887 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AC108463.2-201ENST00000451230 412 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 PTMAP1-205ENST00000455552 325 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 PABPC1P10-201ENST00000464731 381 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AC005550.2-201ENST00000476382 318 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 PRR13-204ENST00000547368 688 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AC137735.1-201ENST00000581911 419 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 MIR4470-201ENST00000583453 72 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AC097381.3-201ENST00000608962 462 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 SOX6-211ENST00000528429 2656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 PARP2-201ENST00000250416 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 DCP1B-205ENST00000540622 1547 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 MMACHC-203ENST00000616135 1510 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 SCIN-209ENST00000519209 2660 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 EIF3EP2-201ENST00000423042 1814 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 RGS6-205ENST00000406236 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 LINC01095-202ENST00000507726 1715 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 TMEM209-206ENST00000473456 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AC007066.2-201ENST00000561961 1993 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 MFSD8-227ENST00000641393 4069 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AL591379.1-201ENST00000315293 3739 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 ANAPC5-204ENST00000441917 2147 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 MUSK-205ENST00000374448 2754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 MMP10-201ENST00000279441 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 ORM1-201ENST00000259396 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AF274855.1-201ENST00000411474 850 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 FAM96B-201ENST00000422424 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AL356309.1-201ENST00000425153 339 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 FTLP17-201ENST00000432567 525 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 CLDN34-201ENST00000445307 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 LINC01832-201ENST00000446520 553 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 PFN2-213ENST00000494827 793 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 IGLV1-62-201ENST00000518003 441 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AC100854.1-201ENST00000520351 341 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AC026458.1-201ENST00000564330 438 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 MIR4437-201ENST00000581331 60 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 ZNF561-AS1-208ENST00000592851 782 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 C5orf56-207ENST00000621237 486 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AC008626.2-201ENST00000624425 248 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 TPD52-204ENST00000517427 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 NBEA-202ENST00000379922 3794 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms