Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFP62-207ENST00000512132 4010 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM122C-202ENST00000370785 1344 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCGB1D2-201ENST00000244926 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNOT9-202ENST00000295701 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAGE5-202ENST00000374952 428 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC084030.1-202ENST00000413385 880 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPSAP2-201ENST00000416785 888 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL5P27-201ENST00000437011 881 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKR1C3-202ENST00000439082 972 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000474.1-201ENST00000441465 680 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355537.1-201ENST00000446589 450 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR51P1P-201ENST00000447547 942 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PMS2P11-201ENST00000451831 574 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCDP1-201ENST00000455244 1081 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC013275.1-202ENST00000457436 501 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027338.2-201ENST00000504382 526 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UQCRBP3-201ENST00000509483 312 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02428-203ENST00000513793 438 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL158819.1-201ENST00000514681 398 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136088.1-201ENST00000531002 541 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMCO2-203ENST00000535986 1096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02443-201ENST00000536518 585 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM69-204ENST00000558329 1211 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009269.2-201ENST00000559892 474 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC245033.1-201ENST00000562833 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYL12A-206ENST00000578611 1004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDPD1-206ENST00000581276 1055 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCM3AP-AS1-207ENST00000588753 589 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CUX2P1-201ENST00000606426 298 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005785.2-201ENST00000624655 631 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026950.2-201ENST00000633456 470 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590396.3-201ENST00000636334 300 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLF8-206ENST00000640927 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC119674.1-217ENST00000641942 1086 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMACHC-203ENST00000616135 1510 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OXCT1-204ENST00000509987 1441 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBMX2P2-201ENST00000257020 946 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR14I1-201ENST00000342623 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP238-201ENST00000365464 120 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNAB1-202ENST00000389634 1119 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRBV9-201ENST00000390363 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRBV3-1-201ENST00000390387 391 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNRPD3-202ENST00000402849 567 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED20-203ENST00000409060 815 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL451048.1-201ENST00000413328 217 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009413.1-201ENST00000414823 399 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00159-202ENST00000414877 428 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UQCRHP2-201ENST00000415651 288 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001043.1-203ENST00000415824 407 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBMY2FP-202ENST00000420346 1263 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000431.1-201ENST00000424219 469 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 G6PC2-204ENST00000429379 645 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EMC3-AS1-204ENST00000430621 683 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL159166.1-201ENST00000437430 329 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104772.1-201ENST00000444764 862 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL451074.4-201ENST00000447545 470 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL451081.2-201ENST00000448115 933 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGF12-AS3-201ENST00000452848 291 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092687.2-201ENST00000452909 568 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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