Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 TYW1B-203ENST00000620995 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 GABRA6-201ENST00000274545 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 COL6A4P1-202ENST00000487147 4317 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 MKL2-209ENST00000574045 3309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 THOC1-201ENST00000261600 2087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 CDH17-202ENST00000441892 2204 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 MACROD2-202ENST00000378058 4025 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 GNG13-201ENST00000248150 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 ZNF121-201ENST00000320451 1563 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 KRTAP19-6-201ENST00000334046 330 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 DEFB119-201ENST00000339144 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 TRAV22-201ENST00000390450 464 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 SNORA3.1-201ENST00000408166 111 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 AC009413.1-201ENST00000414823 399 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 RPL34P19-201ENST00000415903 342 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 AF274573.1-201ENST00000430535 494 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 ANKRD54P1-201ENST00000433115 471 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 AC005040.1-201ENST00000437783 482 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 PRKAR1AP1-201ENST00000441422 1162 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 AC138207.1-201ENST00000442757 545 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 IGKV1OR2-2-201ENST00000451163 355 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 FGF12-AS3-201ENST00000452848 291 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 LINC01006-207ENST00000458645 738 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 RPL34P34-201ENST00000465389 354 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 RPS14P7-201ENST00000473701 448 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 AL928654.1-201ENST00000476081 354 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 CARD8-214ENST00000520007 614 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 AC103974.1-201ENST00000527285 874 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 SGK1-223ENST00000528577 1850 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 AC103855.4-201ENST00000533158 265 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 PTPRJ-AS1-201ENST00000533964 301 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 AC068790.1-201ENST00000536166 355 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 SLC24A1-209ENST00000537259 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 SIPA1L1-203ENST00000537413 4129 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 AC022898.1-202ENST00000560864 806 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 AC133552.3-201ENST00000572236 1869 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 LINC00469-203ENST00000579749 583 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 AL589765.5-201ENST00000596133 515 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 AL035417.2-201ENST00000603887 796 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 RN7SL778P-201ENST00000607160 297 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 AC097381.3-201ENST00000608962 462 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 AL139123.1-201ENST00000612008 430 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 AC061709.1-202ENST00000615029 527 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 Metazoa_SRP.27-201ENST00000617573 258 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 uc_338.37-201ENST00000620113 186 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 LAMTOR5-AS1-248ENST00000630488 703 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 AC067968.1-201ENST00000591793 3766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 ZNF235-201ENST00000291182 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 TMEM209-206ENST00000473456 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 ATP1A4-201ENST00000368081 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 NRXN1-206ENST00000402717 2508 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 TNFAIP8-204ENST00000503646 2502 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 OR4Q2-201ENST00000541415 2778 ntAPPRIS P5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 ADA2-202ENST00000330232 3195 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 WDCP-202ENST00000406895 3700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 THSD4-AS1-202ENST00000562634 2182 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 AC106712.1-201ENST00000483840 1888 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 NOX1-201ENST00000217885 1734 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 LINC01653-201ENST00000456026 1728 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 GPM6A-202ENST00000393658 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SGCZQ96LD1 NPIPB4-203ENST00000415645 3606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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