Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC002066.1-202ENST00000439070 699 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC005515.1-201ENST00000456368 289 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 OR7E62P-201ENST00000456741 477 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 LINC00518-202ENST00000479822 906 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 RN7SL516P-201ENST00000496127 297 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 PTTG3P-201ENST00000521862 606 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 OR7E161P-201ENST00000533722 967 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC122688.2-201ENST00000543922 585 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 GNG2-215ENST00000557376 573 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC012291.1-201ENST00000559666 429 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC023813.3-201ENST00000561876 539 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 OR7A1P-201ENST00000601206 970 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AL589743.4-201ENST00000610763 586 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 C8orf34-208ENST00000523686 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 LINC02073-201ENST00000588341 2845 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 NUMB-231ENST00000559312 1439 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 SOCS5P5-201ENST00000402732 1586 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 NPIPB11-201ENST00000524087 3653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 OR2G6-203ENST00000641804 6084 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AL606490.2-201ENST00000457562 1330 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 OR2A20P-201ENST00000479887 2913 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 FAR2-202ENST00000536681 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC009166.2-201ENST00000624410 2833 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 BDNF-209ENST00000420794 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 LINC00683-202ENST00000579781 3510 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 LINC02035-201ENST00000610128 5476 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 CRBN-201ENST00000231948 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AKT3-202ENST00000336199 1688 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 NR3C1-205ENST00000415690 3789 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 PRKAA1-201ENST00000296800 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 RN7SKP174-201ENST00000363803 330 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 LL22NC01-81G9.3-201ENST00000400221 992 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AL691515.2-201ENST00000414765 466 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AL049651.2-202ENST00000419734 412 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 LINC00578-202ENST00000442937 612 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 RPL24P8-201ENST00000446071 474 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC025271.1-201ENST00000485045 429 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC097494.1-201ENST00000512898 732 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC027541.1-201ENST00000519306 485 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 CCDC60-204ENST00000539847 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AL136018.1-202ENST00000555300 488 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC007785.3-202ENST00000601033 518 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 MIR205HG-210ENST00000603283 455 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 CUX2P1-201ENST00000606426 298 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 SNORD91A-202ENST00000609620 191 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC244196.1-201ENST00000620569 409 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 RAB28P4-201ENST00000622233 665 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC073263.3-201ENST00000624449 858 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 METAP1-212ENST00000625963 147 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 JAKMIP2-AS1-202ENST00000627433 831 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC002115.2-201ENST00000640449 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC119674.1-209ENST00000642031 997 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 WNK1-220ENST00000574564 1401 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 BVES-AS1-202ENST00000369122 1716 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 ZNF540-206ENST00000589117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 MUC21-201ENST00000376296 3651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms