Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 AC027808.2-203ENST00000558261 638 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC024270.1-201ENST00000559181 404 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC018521.4-201ENST00000578239 531 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 EDRF1-AS1-205ENST00000601363 712 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC006238.1-201ENST00000609787 534 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC239803.3-201ENST00000614663 494 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 FAM184A-213ENST00000617072 1251 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AL512604.2-201ENST00000426946 1314 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 UIMC1-211ENST00000510698 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 PPIA-204ENST00000468812 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 TIMD4-201ENST00000274532 1369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 EEF1A1P11-201ENST00000415278 1389 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 FOXM1-201ENST00000342628 3475 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 ESRP1-203ENST00000433389 3770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 EPB41L5-202ENST00000331393 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 BX664727.3-202ENST00000421686 1761 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AL161756.1-201ENST00000555861 1751 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 RAD21L1-203ENST00000409241 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AL034397.3-202ENST00000621933 1815 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 GLRA3-202ENST00000340217 3065 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 BRD7P1-201ENST00000557705 1915 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 MGC27382-202ENST00000436742 1993 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 GPBP1-203ENST00000424459 4683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 TARS2P1-201ENST00000506124 2041 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 LRRC8B-203ENST00000439853 7474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 NUDT13-202ENST00000357321 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 DET1-202ENST00000444300 2154 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 MAPK10-319ENST00000641459 2542 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 KCNA2-214ENST00000640774 6673 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 DGKG-203ENST00000382164 3152 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 CCDC39-201ENST00000442201 3279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 OR5E1P-201ENST00000305754 927 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 OR4D9-201ENST00000329328 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 RNU1-47P-201ENST00000362966 163 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC093392.1-201ENST00000366280 340 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 RPS24-202ENST00000372360 510 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 ARR3-202ENST00000374495 1298 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 SMARCA2-205ENST00000382183 1178 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 MIR654-201ENST00000385199 81 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 RNA5SP256-201ENST00000390978 113 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AL138807.1-201ENST00000400354 459 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC008770.1-201ENST00000406892 1257 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 RNA5SP265-201ENST00000411023 111 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC003080.1-201ENST00000413552 767 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 PROX1-AS1-201ENST00000413560 496 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 POLR1B-204ENST00000417433 3836 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 CHL1-AS1-201ENST00000417612 913 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC006455.4-201ENST00000418297 528 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC008496.2-201ENST00000421252 460 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 RPL7P7-201ENST00000428803 703 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC012506.4-202ENST00000430051 572 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 NEFLP1-201ENST00000436364 984 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 OSBPL10-AS1-204ENST00000436598 513 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 CLDN34-201ENST00000445307 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC073188.4-201ENST00000450077 528 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 LINC01548-201ENST00000451980 696 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC002463.1-201ENST00000453459 1188 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC017002.3-201ENST00000455309 757 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC004801.2-201ENST00000468202 779 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms