Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AL358394.2-201ENST00000427229 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 ADGRL3-214ENST00000511324 5042 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 TMEM230-204ENST00000379277 1536 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 MEG8-201ENST00000414488 800 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 LINC01393-202ENST00000435981 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AC114755.1-201ENST00000453101 868 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 UCK2-206ENST00000470820 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AC105202.1-203ENST00000518024 875 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AC093909.6-201ENST00000624757 775 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 ARHGEF3-214ENST00000497267 2197 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 FAM20A-207ENST00000619787 2798 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 SMN2-214ENST00000626847 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 CPEB4-201ENST00000265085 9483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 FGF9-201ENST00000382353 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 MAP3K7CL-203ENST00000341618 1855 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 TRIM2-201ENST00000338700 6735 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 HOPX-204ENST00000381260 1141 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 FDPSP6-201ENST00000425091 512 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AL121983.2-201ENST00000426899 688 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 KCND3-AS1-202ENST00000427471 583 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AL645936.2-201ENST00000430565 928 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 LINC01762-205ENST00000437308 539 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AL354714.5-201ENST00000450131 590 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 RPS4XP19-201ENST00000460237 736 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 RN7SL456P-201ENST00000469290 295 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 RN7SL518P-201ENST00000491887 280 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AC109454.2-201ENST00000503470 520 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AC079921.2-201ENST00000507579 455 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 RPL7L1P7-201ENST00000509986 724 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 IGHVIII-25-1-201ENST00000522143 241 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AP001994.1-201ENST00000527539 826 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AL135978.1-201ENST00000553618 1266 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AC011447.2-201ENST00000592921 283 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 RPS4XP16-202ENST00000595905 807 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AC019080.4-201ENST00000606200 564 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 PAIP2B-201ENST00000244221 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 TCL6-201ENST00000352367 3398 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 EEF1A1P28-201ENST00000450915 1403 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 IL22RA2-203ENST00000349184 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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