Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT8

HECTD1, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD1, humanhuman

Predictions only

Length 2,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD1Q9ULT8 CTNND1-232ENST00000532649 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 CTNND1-237ENST00000534579 6024 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 RUNX1T1-248ENST00000613302 7687 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 LINC01695-203ENST00000453420 4486 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 CREB3L2-207ENST00000616381 7133 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 MED1-202ENST00000394287 2870 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 CREM-214ENST00000395887 849 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 AL354794.2-201ENST00000424795 1248 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 AC104389.2-201ENST00000450768 887 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 LINC00533-201ENST00000456103 537 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 CREM-224ENST00000468236 582 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 CREM-236ENST00000487763 429 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 AC055758.2-201ENST00000495382 799 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 MFN1-205ENST00000471841 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 LRRC8B-206ENST00000640258 8034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 NNT-AS1-204ENST00000513560 4769 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 KIRREL1-203ENST00000368172 6870 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 SLC24A1-209ENST00000537259 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 NANOG-201ENST00000229307 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 AL049646.1-201ENST00000457009 2490 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 AL391095.1-201ENST00000422519 2004 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 C3orf30-201ENST00000295622 1814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 ALMS1-206ENST00000613296 12925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 MITD1-201ENST00000289359 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 GEMIN2P2-201ENST00000418195 715 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 LINC01393-202ENST00000435981 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 SETP16-201ENST00000531054 711 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 AC026336.5-201ENST00000624455 738 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 MYOM1-201ENST00000261606 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 XIRP2-205ENST00000409605 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 ZHX3-214ENST00000559234 6296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 EYA1-202ENST00000340726 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 ZNF45-206ENST00000615985 2912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 ATG13-203ENST00000524625 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 SATB1-204ENST00000417717 4589 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 BTBD3-215ENST00000618918 4486 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 EFHC1-233ENST00000637353 3829 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 CHD7-202ENST00000524602 3456 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 MAPK10-319ENST00000641459 2542 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 AC027801.3-201ENST00000515049 698 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 STARD13-AS-240ENST00000609608 865 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 CRNDE-214ENST00000637011 865 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 TCAM1P-205ENST00000478379 3317 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 ADAMTS20-201ENST00000389420 6076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 CYFIP2-209ENST00000521420 6370 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 TMEM59-204ENST00000371344 2473 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 MCTP1-204ENST00000505078 2629 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 EIF4E3-204ENST00000425534 9949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 ATF7-202ENST00000456903 5218 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 TBC1D3P1-DHX40P1-201ENST00000587125 1841 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HECTD1Q9ULT8 NHLRC3-202ENST00000379600 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 313.4 ms