Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 LINC01013-201ENST00000422700 1831 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 DCAF13-210ENST00000618975 2038 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 LEKR1-204ENST00000470811 2881 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 OSGEPL1-204ENST00000519810 2216 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 ADAL-202ENST00000422466 3767 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 INPP4B-212ENST00000507861 1506 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 DCP1B-205ENST00000540622 1547 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 MEPE-208ENST00000540395 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 NDFIP2-206ENST00000620924 2324 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 SERPINA11-201ENST00000334708 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 BANF2-201ENST00000246090 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 RNU1-38P-201ENST00000362817 144 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 SNORA70.8-201ENST00000384231 136 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 SRSF7-202ENST00000409276 1050 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AL591368.1-202ENST00000413050 548 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC008758.2-201ENST00000420038 695 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 G6PC2-204ENST00000429379 645 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC009299.1-201ENST00000429684 717 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 PRPS1P2-201ENST00000430496 937 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AL450384.2-202ENST00000436485 656 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 RPSAP7-201ENST00000456871 885 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 LINC00881-201ENST00000467995 589 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 RN7SL688P-201ENST00000471754 275 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 CLDND1-205ENST00000502288 560 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 OR7E1P-201ENST00000533891 958 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 HIGD1AP9-201ENST00000550710 279 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC012181.2-201ENST00000570210 699 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AP001120.4-201ENST00000590231 108 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC010605.1-201ENST00000597303 797 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 HOTTIP_2.1-201ENST00000616633 376 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC078909.2-201ENST00000620584 398 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC005785.2-201ENST00000624655 631 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 ALKBH8-202ENST00000389568 2491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 DPPA4-201ENST00000335658 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 CACNB4-219ENST00000636108 1698 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 LINC01808-203ENST00000641932 1643 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 IFT22-201ENST00000315322 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 IFNA16-201ENST00000380216 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 A2ML1-AS2-201ENST00000394240 386 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 RPL7-203ENST00000396466 762 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 HNRNPH1P2-201ENST00000396845 1210 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 OR7E91P-201ENST00000400027 866 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC015987.1-201ENST00000419211 804 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 EMC3-AS1-204ENST00000430621 683 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 LINC01732-201ENST00000435023 542 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 ATP5G1P6-201ENST00000451206 412 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 RN7SL160P-201ENST00000468558 284 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 CHCHD7-205ENST00000517933 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC013643.2-201ENST00000521510 584 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 CHCHD7-215ENST00000523061 557 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 ZNF726-203ENST00000525354 806 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC103974.1-201ENST00000527285 874 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC068631.3-201ENST00000538831 225 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC092868.2-201ENST00000558749 497 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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