Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AL359633.1-201ENST00000421403 310 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AC083864.2-201ENST00000446024 482 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 SCDP1-201ENST00000455244 1081 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AC013429.1-201ENST00000456604 422 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 SNORA35.1-201ENST00000458908 128 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 GLRXP3-201ENST00000470810 321 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AC015820.1-201ENST00000473882 321 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AC009153.1-201ENST00000485799 496 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AF279873.3-204ENST00000523336 784 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 BLID-201ENST00000560104 862 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AP005328.2-201ENST00000606879 657 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AC012510.1-201ENST00000607946 759 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 KRTAP4-1-202ENST00000620667 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 MRPS31-201ENST00000323563 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AL133320.1-201ENST00000621423 2352 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 SRFBP1-201ENST00000339397 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 GINS4-201ENST00000276533 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 NPIPB4-203ENST00000415645 3606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 RHOJ-201ENST00000316754 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 BRS3-201ENST00000370648 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 CDY1-201ENST00000306609 2321 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 CDY1B-201ENST00000306882 2321 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 LRIG3-202ENST00000379141 3667 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 CRNKL1-207ENST00000536226 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 NUP210L-202ENST00000368553 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 ADGRB3-201ENST00000238918 2927 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 ETS1-202ENST00000392668 5139 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 SLC2A3P4-201ENST00000521259 1471 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AL357556.1-201ENST00000421884 1388 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 LMO7-205ENST00000377534 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 DEFB4A-201ENST00000302247 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 OR4A16-201ENST00000314721 1081 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC023886.2-201ENST00000321285 411 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 DEFB119-201ENST00000339144 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 SOD1P1-201ENST00000407803 440 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 RPL5P4-201ENST00000434805 886 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AP001048.1-201ENST00000436359 280 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC138207.1-201ENST00000442757 545 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 LIN28AP2-201ENST00000445283 458 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AL772337.3-201ENST00000447524 452 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC108868.2-201ENST00000451464 511 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 NUCKS1P1-201ENST00000452067 703 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 RPL21P42-201ENST00000488408 464 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC016559.1-201ENST00000511420 199 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 IGKV2-29-201ENST00000521304 372 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC023078.5-201ENST00000528646 707 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AL118558.1-201ENST00000557551 566 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC105275.2-201ENST00000567907 711 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC136624.3-201ENST00000571660 567 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 LINC01440-208ENST00000627300 699 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 PGRMC2-202ENST00000394276 2858 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 UBN1-208ENST00000590769 3530 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 CNPY1-204ENST00000636446 1637 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 SFR1-201ENST00000369727 1438 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms