Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 TUG1_3.1-201ENST00000616187 237 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC012560.1-201ENST00000634930 459 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 SGO1-AS1-206ENST00000635369 442 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 LINC01105-204ENST00000444416 2695 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 ZNF334-206ENST00000625284 2495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC004941.1-201ENST00000417506 3120 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AL022334.1-201ENST00000417397 1726 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 GTF2H1-210ENST00000530496 1700 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 ZNF268-213ENST00000542986 3773 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 ZC3H11A-203ENST00000367212 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 SLC7A8-206ENST00000469263 3557 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 DAZ2-206ENST00000382440 4119 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 GABRR1-203ENST00000454853 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 LINC02208-201ENST00000506769 2803 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 NBR1-201ENST00000341165 4656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 ZNF887P-201ENST00000431363 1407 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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ATG4DQ86TL0 CD46-209ENST00000367047 3089 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 CKAP2-203ENST00000378037 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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ATG4DQ86TL0 ZNF451-204ENST00000370708 9478 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 DDX11L16-201ENST00000507418 1306 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AGR2-203ENST00000419304 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 TRIM59-208ENST00000543469 4615 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 MRPS31-201ENST00000323563 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 HSD11B1-203ENST00000367028 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 KIAA1143-201ENST00000296121 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 TCF12-206ENST00000543579 1809 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 TBC1D19-205ENST00000511789 1386 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 APOB-201ENST00000233242 14121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 PPIH-201ENST00000304979 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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ATG4DQ86TL0 GSTM1-203ENST00000369819 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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ATG4DQ86TL0 PRPSAP2-217ENST00000542013 1047 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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ATG4DQ86TL0 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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ATG4DQ86TL0 AC243654.1-201ENST00000620218 293 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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ATG4DQ86TL0 LINC00598-212ENST00000637124 905 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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ATG4DQ86TL0 GPM6A-221ENST00000515090 1500 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 ZNF334-201ENST00000347606 3890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 FAM19A2-211ENST00000550003 2499 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 LINC00960-202ENST00000492922 2126 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 CASR-201ENST00000490131 4015 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 CYP2C19-202ENST00000480405 1417 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 OXCT1-205ENST00000510634 1441 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 TXNRD1-219ENST00000529546 2018 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 ZKSCAN5-201ENST00000326775 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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