Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 SCYL3-202ENST00000367771 6364 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
POLD1P28340 TMEM99-204ENST00000622451 2073 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
POLD1P28340 FMN2-206ENST00000543681 2902 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
POLD1P28340 MORF4L2-208ENST00000441076 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
POLD1P28340 MAPK10-329ENST00000641555 2656 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
POLD1P28340 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 CD46-205ENST00000358170 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 CTNND1-207ENST00000426142 5800 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 CAST-236ENST00000511782 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 FASLG-202ENST00000367721 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 R3HDM2P1-201ENST00000505381 1960 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 AC073842.1-201ENST00000376482 342 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 NDUFB2-210ENST00000475276 539 ntTSL 4 BASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 RN7SL569P-201ENST00000494652 288 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 AC026458.1-201ENST00000564330 438 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 AC127071.2-201ENST00000623293 527 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 PIBF1-208ENST00000617689 2882 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 AC026356.1-201ENST00000622688 1357 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 ZFX-201ENST00000304543 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 STC1-201ENST00000290271 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 ITK-201ENST00000422843 4528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 LRRC37A2-201ENST00000333412 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 HKR1-223ENST00000591471 3472 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 FHL1-204ENST00000370683 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
POLD1P28340 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 KPNA6-201ENST00000373625 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 NF1P2-201ENST00000556855 2505 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 CD86-201ENST00000264468 2634 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 EPYC-201ENST00000261172 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 CACYBP-209ENST00000613570 2835 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 WDR31-203ENST00000374195 3101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 AL160290.1-201ENST00000415509 416 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 AC074286.1-202ENST00000441205 567 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 SUMO2P17-201ENST00000504438 285 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 EEF1B2P1-201ENST00000567221 672 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 AC105275.2-201ENST00000567907 711 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 AC097381.3-201ENST00000608962 462 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 DAPL1-204ENST00000621326 671 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 VLDLR-AS1-201ENST00000416826 3167 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 FAM107A-202ENST00000394481 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 NQO1-203ENST00000379047 2527 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 BLNK-203ENST00000413476 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 ZNF814-201ENST00000435989 3146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 Z99129.3-201ENST00000624363 6430 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 CDC40-201ENST00000307731 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLD1P28340 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLD1P28340 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLD1P28340 OTX2-201ENST00000339475 3001 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLD1P28340 AKAP3-206ENST00000545990 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLD1P28340 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
POLD1P28340 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLD1P28340 NUMB-223ENST00000556772 5172 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLD1P28340 MAGT1-205ENST00000618282 2788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLD1P28340 OPRM1-205ENST00000414028 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLD1P28340 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLD1P28340 OR2A4-201ENST00000315453 1758 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLD1P28340 PKP4-202ENST00000389759 4443 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms