Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGEF1Q9Y6D6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms