Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P2

CSAG2, Chondrosarcoma-associated gene 2/3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG2Q9Y5P2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSAG2Q9Y5P2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms