Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms