Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GINS2Q9Y248 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms