Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms