Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN74

PCDHA4, Protocadherin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA4Q9UN74 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHA4Q9UN74 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHA4Q9UN74 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHA4Q9UN74 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms