Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms