Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms