Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CHIC2Q9UKJ5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms