Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUF60Q9UHX1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms