Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MLH3Q9UHC1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
MLH3Q9UHC1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
MLH3Q9UHC1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MLH3Q9UHC1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MLH3Q9UHC1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MLH3Q9UHC1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MLH3Q9UHC1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MLH3Q9UHC1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MLH3Q9UHC1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MLH3Q9UHC1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MLH3Q9UHC1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MLH3Q9UHC1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MLH3Q9UHC1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MLH3Q9UHC1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MLH3Q9UHC1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MLH3Q9UHC1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MLH3Q9UHC1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MLH3Q9UHC1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MLH3Q9UHC1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MLH3Q9UHC1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MLH3Q9UHC1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms