Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms