Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
APEX2Q9UBZ4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms