Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PODXL2Q9NZ53 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms