Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms